在拉讓江流域，這個剛成立的社群占據了詩巫旁邊叢林中的一小塊空地；富雅各要牧養他們，將會面對艱難的挑戰。因為這裡基礎建設和設施匱乏，這些僑民一方面要辛勤地種稻米糊口，另一方面還要預防各種肆虐的熱帶疾病。由於原住民的土地受到侵占，華僑農民與當地達雅族人的關係，也持續在仇視與緊張中。
正當此時，富雅各與所牧養的人之間的溝通也困難重重。他在檳城時學會了一些馬來話，也學到少許的福建方言；而現在卻要開始學福州話。他也要面對思鄉和孤寂的情緒；還好這種種情緒在1904年與楊瑪莉(Mary Young)結婚之後，就得到大大的改善了。
雖然如此，他仍然全心投入服事，向當地的僑胞教導聖經真理，鼓勵華人家庭在信仰上忍耐、堅持，又訓練年輕人以平信徒的身分講道。他相信宣教工作不只在於屬靈方面的教導，他們夫婦倆更是花很多時間來照顧居民的實際生活需要。他知道他不但要支持當地居民奔走信心的旅程，更要改善他們的社會和經濟生活，這兩者是密不可分的。於是，他們幫助村民建立男校和女校，建築房屋和公路，又想辦法增加他們的農作收成。
事實上，富雅各三十多年在拉讓江沿岸的服事過程中，已經建立了開拓先鋒和牧者的名聲。他在運輸、農業、教育和通訊方面都引進了很多個「第一」。這長長的名單包括第一輛腳踏車、第一艘汽船，協助農民運輸農產品；第一粒橡膠種子和第一台電動碾米機；第一間女校、第一間農業學校、第一部製冰機、電鋸、發電機和無線電報機。有一次他說：「除了我所建立的教堂和學校、以及與上帝同工來幫助人改變生命，我最引以為豪的就是我的船隻。」
富雅各還扮演了地方仲裁之類的角色，也是華人與達雅族(他後來贏得他們的尊重)之間的糾紛調停者，還成為福州華人與英國殖民地官員的中間人。1904年，英國殖民地官員委任他為「福州人的維護者」，這個職銜有利於他接觸相關的官員並處理事務，例如為僑民爭取更多土地等等。他最大的榮譽是受華人社會稱他為「富先生」，當地馬來人也稱呼他為Tuan Hoover；反映出富雅各在牧養上帝羊群的同時，也得著當地人無比的尊重與愛戴。
1935年富雅各死於瘧疾。那時，他們夫婦倆已建立了41間堂會和40間學校，有超過千名兒童受洗和受教育。他所牧養的那小村子原本只有500人，如今已發展成有數千人居住的現代化社區、有引以為豪的學校、自立自足的教會，還有數以萬計英畝的農耕地，這些部分要歸功於富雅各幫助福州華人發展社會和經濟的決心。
在今天的砂拉越和沙巴有超過120間衛理公會堂會，以及超過六萬名敬拜者。這些信徒們代表著他所留下的傳承，他沉著的決心、安靜忍耐、忠心順服主耶穌的命令，到地極成為祂的見證。從賓夕凡尼亞州的一個小鎮到砂拉越叢林裡的小空地，富雅各憑著信心邁出每一個小步伐，讓上帝呼召的確據在心裡生根，並以一切所有的來回應。就算遭逢艱難的處境，他依舊堅持到底，從不偏離上帝差派他去做的工作。
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